壹
流行病学方面：
修订版在11月下旬发布，在前言部分就提到我国即将进入流感流行季节。
去除了上一版中的内容：受感染动物也可成为传染源，人感染来源动物的流感病例在近距离密切接触可发生有限传播。人感染H5N1/H7N9病例排毒可达1～3周。
仅提及：病毒在人呼吸道分泌物中一般持续排毒3～6天，儿童、免疫功能受损患者排毒时间可超过1周。
传播途径强调了：流感主要通过打喷嚏和咳嗽等飞沫传播，经口腔、鼻腔、眼睛等黏膜直接或间接接触感染。接触被病毒污染的物品也可通过上述途径感染。
在对于重症患者高危人群内容中：尽早（发病48小时内）给予抗病毒药物治疗，进行流感病毒核酸检测及其他必要检查。将 发病48小时内 删除。并且将妊娠期妇女，改为妊娠及围产期妇女。
从上述方面的修订可以发现，修订版对监护人群有适当的扩大。
贰
发病机制及病理方面：
新增：儿童可发生急性坏死性脑病。儿童急性坏死性脑病表现为丘脑为主的对称性坏死性病变，局部无明显炎症反应。
叁
实验室检查方面：
去除了：检测流感病毒特异性IgM和IgG抗体水平。
保留：动态检测的IgG抗体水平恢复期比急性期有4倍或以上升高有回顾性诊断意义。
确诊方法部分，去除了具体的方法学要求：流感病毒核酸检测阳性（可采用real-time RT-PCR和RT-PCR方法）。
肆
治疗部分：
住院标准部分也同上文一样，将围产期妇女纳入。
避免盲目或不恰当使用抗菌药物。仅在流感继发细菌性肺炎、中耳炎和鼻窦炎等有细菌感染指征时才有使用抗菌药物的指征。去除了具体的并发症病种罗列，更加宽泛。
对症治疗方面：根据缺氧程度可采用鼻导管、开放面罩及储氧面罩进行氧疗。改为「适当的方式进行氧疗」。临床操作上更便于因地制宜。
抗病毒治疗时机方面改动较大：
发病 48 h 内进行抗病毒治疗可减少流感并发症、降低住院患者的病死率、缩短住院时间，发病时间超过 48 h 的重症患者依然能从抗病毒治疗中获益。
重症流感高危人群及重症患者，应尽早（发病 48h 内）给予抗流感病毒治疗，不必等待病毒检测结果；如果发病时间超过 48 h，症状无改善或呈恶化倾向时也应进行抗流感病毒治疗。
无重症流感高危因素的患者，发病时间不足 48 h，为缩短病程、减少并发症也可以抗病毒治疗。
改为：
重症或有重症流感高危因素的患者，应尽早给予抗流感病毒治疗，不必等待病毒检测结果。发病 48 h 内进行抗病毒治疗可减少并发症、降低病死率、缩短住院时间；发病时间超过 48 h 的重症患者依然可从抗病毒治疗中获益。
非重症且无重症流感高危因素的患者，在发病48 h 内，在评价风险和收益后，也可考虑抗病毒治疗。
抗流感病毒治疗药物：
奥司他韦增加了剂型的说明（胶囊、颗粒）。去掉了：对于吞咽胶囊有困难的儿童，可选用奥司他韦颗粒剂。对用药过程中无效或病情加重的患者，要注意是否出现耐药。
中成药方面增加了莲花清瘟和清开灵的不同剂型。
中药方剂方面：
「麻杏石甘汤」加减中，将生石膏（先煎）的剂量由
增加了：苔厚腻加苍术
「宣白承气汤加减」中，同样将生石膏（先煎）的剂量由
伍
预防方面：
推荐疫苗接种的人群有修改：推荐60岁及以上老年人、6月龄至5岁儿童、孕妇、6月龄以下儿童家庭成员和看护人员、慢性病患者和医务人员等流感高危人群，人群，每年优先接种流感疫苗。
一般预防措施中，对于咳嗽或打喷嚏时的礼貌，除了用纸巾、毛巾等遮住口鼻以外，增加了可以使用上臂遮挡。
