随着教育管理体制改革的深化，中国上百所高等院校正在进行“合并”、“重组”。1998年9月，浙江大学与杭州大学、浙江农业大学、浙江医科大学合并。今年又有北京大学与北京医科大学合并，西安交通大学与西安医科大学、陕西财经学院合并，复旦大学与上海医科大学合并，同济大学与上海铁道大学合并，东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并，南京地质学校也同时并入该校。一年来，一系列高校重新组建成新的大学。
瞿振元说，按教育部的规定，宣布一所新学校成立，就要撤销原学校的建制。如北京大学与北京医科大学合并组建新的北京大学，就要同时撤销原北京大学和原北京医科大学的建制，新学校成立后，法人代表是新的北京大学。因此，招生、就业、学生的学籍学历管理都要由新组建的学校负责。
考虑到高校的实质性合并工作需要一定时间，今年合并的高校仍将继续执行合并前各高校的招生、就业计划，如新的北京大学要执行原北大和原北医大的招生计划，录取通知书由新的北京大学签发。毕业证书发放也按此原则办理。至于合并后高校录取分数线会不会提高，要根据招生计划、报考等情况确定。
瞿振元强调说，在招生工作中，新合并的高校要加大宣传力度，向考生及其家长说明并校以及执行招生计划、发放证书等情况。