此次审计历时一年多，主要针对全省16个地州市的336所中、小学校的普教经费进行审计，审计金额总计933212.96万元。
这些违规违纪金额中，地、州市、县区政府欠拨普教经费最多，达7816.22万元；其次是少数地县教育部门和学校虚列支出，其中使用不规范票据、漏缴各种税费、拖欠教师工资1548.61万元，挤占挪用普教经费1321.6万元，未执行“收支两条线”规定，应缴未缴财政专户1027.74万元。此外，还有一些地县教育行政部门和学校私设小金库，个别地县教育部门和学校乱收费，乱集资。审计中，还查出一地级教育部门和一所学校贪污挪用公款110.19万元。
云南省有关部门表示，将严肃查处这些违规行为，坚决治理一些中小学校财务管理混乱的局面；同时加大对支出的监督检查力度，以保证教育经费安全、有效地使用。