中小学乱收费还呈现出另一个特点：由公开转入隐蔽。如不使用上级发的收费卡；多收少记，且不开正式收据；特别是“择校生”高收费现象愈演愈烈；不能做到“一次收费，三个公开”，学生家长和学校对收费政策、项目、标准搞不清，无法进行有效监督。由于对乱收费查处不力，处理不到位，对反映的问题，有关部门虽然进行了查处，但处罚力度不够，使乱收费的单位和领导不痛不痒，一犯再犯，乱收费歪风难以彻底根除。中小学乱收费屡禁屡犯，说到底还在于管理和监督不力，处罚不到位。
不少地方对中小学的政府投入严重不足，各级财政性教育经费投入只有“人头费”，除用于教职工工资外，真正用于办公的经费很少，这也是一些学校进行乱收费的借口。有的学校甚至振振有词：没有钱，正常教学如何开展？在这种情况下，教育部门在查处时往往会有意无意间生出“恻隐”之心，查处的办法和治理的力度也就宽松不一。
要彻底根除、治理中小学乱收费，必须标本兼治，建立一套统一可行的规范化、标准化、制度化的收费方式，实行收费与花钱、管钱分离制度。在城镇可以试行银行代收学杂费和书费的方式。中小学不得直接向学生收费。只要严格这一条规定，乱收费就会根除。银行可按省级政府制定的统一收费标准和教育行政部门核定的中小学书目价格，每学期由学校向银行提供学校交费学生人数，由家长向银行直接交费，所交费用由教育行政部门或中小学统一设账，财务进行集中管理。只有这样解决，才能彻底治理中小学的乱收费问题。
中小学收费制度涉及千家万户及整个社会，也是社会对教育反映最强烈的热点问题之一，如果真正能这样去做，那么中小学乱收费现象就会不禁而止。