这次会议还决定，从明年起，专科层次高等教育（包括普通和成人专科层次学历教育）的招生计划改由省级人民政府制定并管理。这加大了省级政府发展高等教育的责任和权力，是高等教育管理体制改革的一项重要内容，对我国高等教育的发展将会产生深远的积极影响。
会议总结了全国今年高等教育招生计划执行情况。据统计，1999年全国各类高等教育实际招生为280万人，其中普通高等教育招生约160万人，较上年增加51万人，增长47％，在校生人数较上年增加76万人，增长22％；成人高等教育招生约116万人，较上年增长近16％。1999年全国普通高等教育录取率达到49％，较1998年提高了13个百分点。今年我国高等教育的招生规模是新中国成立以来最大的，为应届高中毕业生和在职人员提供了更多接受高等教育的机会，受到社会各界和人民群众的广泛欢迎。
会议认为，今年高等教育招生计划执行情况总体上是好的，但也出现了一些问题，主要是：高校办学条件赶不上招生发展需要；高等职业技术教育的发展在少数地区不够落实；部分省区收费出现了“双轨制”现象，个别学校擅自高收费、乱收费等。教育部有关负责人强调，今后高等教育收费决不能搞“双轨制”，同时，要坚决规范高校收费制度。
会议指出，经过多年快速发展，我国高等学校办学条件普遍十分紧张，进一步扩大招生后，超负荷运转状况更加严重，对高等教育的质量已产生不利影响。这些情况已引起不少地区的高度重视，有的地方已经在采取有力措施加以解决。各地、各部门对此一定要高度重视，加大对高等教育的投入，同时还要高度重视和大力加强教师队伍的建设。