探索适应学校实际的管理体制
一个适合学校发展需求的的教育管理体制可以促进学校的发展。北京十一学校的发展就是从教育管理体制改革开始的。
通过长期的教育实践，李金初认为，教育作为一种社会历史现象，必然要同社会多种因素相联系，其中最重要的是教育与社会经济的相互作用，即经济决定教育，教育反作用于经济。他分析了我国从计划经济到市场经济转变的各个时期基础教育体制改革的现状后，根据本地、本校实际，选择了“国有民办”的办学体制。即政府将全民所有制的公办学校，按照有法定效力的程序，交由有法人地位的社会团体或公民个人承办，其资产及以后的资产增值仍归国家所有，而事业费和日常运行经费的全部或大部分由承办者依法筹集。承办者享有民间办学的政策权利和办学自主权。具体是“学校国有、校长承办、经费自筹、办学自主”。
教育管理体制的改革，给学校的发展带来了活力。首先，教育经费的筹集更加充足，也更加灵活；其次，通过办学体制的改革，广聘人才、高标准选用人才，实现了“师德高品位、专业高学识、能力多方位”的教师队伍建设总目标；其三，办学水平和教育质量明显提高；其四，得到了社会的普遍承认和支持。
建立适应教学为中心的工作体系
学校的根本任务是培养人才，其基本实践活动是教学，这就决定了学校各项工作必须以教学为中心，统筹安排学校的各项工作。从教育学上讲，它体现了学校的工作性质和特点；从管理学上讲，它符合整体管理和系统管理的原则。
当前一些学校由于缺乏对学校教育工作规律的认识，于是出现两种倾向：一是各自为政，各抓各的，形不成中心；二是只顾中心，忽视了其他工作，形不成“一盘棋”。所以，要按学校教育工作规律管理学校，树立教学为中心的思想，必须统一学校“一班人”的思想；整齐各职能部门的工作步伐；理顺各项工作关系，履行为教学服务的职责。
十一学校在办学体制改革的基础上，深入进行教育、教学领域育人模式的改革。这是学校中心工作的改革。在这一改革工作中，李金初领导全校教职员工围绕处理好当前需要与未来发展的关系、处理好全面发展与个性发挥的关系、处理好知识与能力的关系等问题，从而开展了“综合活动课”和“分层教学”的课堂教学改革。综合活动课是一种以综合性学习为主要内容，以学生的活动及体验学习为主要形式，以促进学生的认知、情感、行为统一协调发展为主要目标的课程及教学组织模式。分层次教学即“按成绩”分班进行扬弃处理，根据选择教育的思想，提出分层教学的措施。
教学改革统筹了学校的工作，各职能部门也围绕教学为中心，各司其职，各负其责。一个中心牵动了学校的全局工作。在李金初办学思想研讨会上可以看出，学校“一班人”对学校改革的思路、工作都是步调一致、协作发展的。
建设适应发展需要的教师队伍
以教学为中心统筹学校的工作，解决了学校系统管理问题，而要培养合格人才，必须依靠教师办学。
李金初把教师队伍建设放在学校四项基本建设的首位，他对教师队伍素质提出的基本要求是：师德高品位、专业高学识、能力多方位。他认为，教师不仅以自己的知识教育学生，而且以自己的行为影响学生，以自己的情感感染学生。教师在学生面前发生的一切行为都是教育行为，都会产生积极的或消极的影响。他严格实行师德“一票否决”制，坚决辞退师德表现差的教师。经过几年努力，十一学校被评为“北京市师德建设先进群体”、“全国民主管理先进单位”。教师学历水平也有很大变化，学校通过进修、招聘和学习研究生课程，现在专职教师中，达到本科学历或具有中学高级职称的已占全体教师的99％，其中有博士、硕士25名，硕士研究生课程班结业的60人，为在学校开展现代教育教学的研究与实验提供了雄厚的人才资源，也是提高学校整体教育质量的重要前提。
李金初在抓教师工作时，是重视教师的物质生活待遇的，他认为“教师的低待遇，只能造成教育的低水平”。他提出“学校利益与个人利益同步发展”的思想，遵循“对教师的待遇，要向提高的方向发展；对教师的管理，要向严格的方向发展”的原则。11年中，十一学校教师经济收入提高了近15倍，促使优秀教师和骨干教师脱颖而出，教师队伍非常稳定。但是“物质利益只能管一阵子，对事业的追求才能受用一辈子”，所以，李金初努力为教师创造在事业上成功的环境和条件；创造优越的心理环境、生活环境；创造良好的教学物质条件；提高教师自身素质。在教师中提倡学术民主，做教学和科研的主人。激励全体教师干事业，出成果。同时，十一学校还发挥自身优势，建立校内外人才流动机制，优化教师群体结构。在聘任制中，坚持双向选择、按需择优、高工作量、评聘分开四原则，优化了教师的专业知识、学历和年龄结构，保证了教师工作的高效率。