高校办企业是改革开放后产学研结合的产物。以北大方正集团为首的校企创造了中国校办产业的辉煌：北大校办产业产值从1994年的10亿元人民币增加到2000年底的120亿元人民币，每年增幅超过30％，上缴国家利税20多亿元，给学校回报近4亿元，成为我国高科技产业和建立经济新增长点的重要力量。
有关人士介绍说，校办产业虽然取得了非凡的成就，但面对新的市场经济表现出了学校承担无限责任与风险、管理体制不顺、校办产业普遍没有建立现代企业制度等诸多的不适应之处，这都极大地制约了企业的发展。
作为国家高校产业改制试点单位之一的北京大学，2000年8月的产业会议后，北大科技开发与产业管理办公室负责着手校办产业的改制工作。经过多方研讨，在对企业改制严格审核与监督，确保国有资产保值增值的基础上，提出整体改制方案：将学校与企业间的关系转换为以资本为纽带的产权关系，学校将以股东（出资人）的身份行使权力，建立完善的以三会（股东会、董事会、监事会）为代表的法人治理结构，建立健全各种规章制度，完善企业内部管理体制。基本原则为“关、停、并、转”，即对于多年经营不善、多年不上交利税的企业实行关闭或停业；对于一些有一定市场前景的企业实行合并、兼并或者根据市场要求“转产”；对于市场前景好、技术实力雄厚的企业进行增资扩股，扩大资产规模，有效利用社会资源。配合学校总体改制方案，以方正集团为首的十多家企业的具体改制方案已经完成，同时已有北大绿地环境工程公司、北大君士、北大英华等几家企业正在进行或已完成了初步的改制工作。
据介绍，北大准备在年底前基本完成“改制”工作，在校办企业中建立起“产权清晰、权责清楚、政企分开、管理科学”的现代企业制度，以进一步规范学校企业的管理体制，为校办企业发展提供更广阔的空间。