首先，“校校通”的基础应用层面要在教学中广泛应用。作为软件企业，广州市唯一数码科技公司认为，有生命力的教育软件是能够用于课堂第一线、贯穿于教师日常工作的。
如果从教委、学校、教师到学生的应用都可以基于不同的网站平台，“校校通”的应用就有了广泛的群众基础。校园网的建设只是搭起了一个很好的教育网络平台，而取得应用实效才是其真正的目的。信息化建设服务于学校管理仅仅是一个方面，最重要的还是服务于教学。“校校通”应用的核心是教学。教学应用开发工具平台(包括课件、教案、组卷)就是信息化教学实现过程的产品。
资源建设采用“整合、共建、共享”的方式，信息化教学的实现才不会是无米之炊。随着信息化教育的普及，教育软件已成为现代教育中必不可少的工具之一，但是，现在的软件市场难尽如人意。
不少商家出于保护知识产权的考虑，往往将课件整体打包，教师无法截取其中的一段；有的课件没有很好的可控性，教师无法在演示过程中及时中止以便插入必要的讲解再继续播放；学生的差异很大，不可能有适用于所有学生的课件；有的课件是完全商业化了的，是照着课本和教学大纲的要求“简单”、“快速”地推出的速成品，这样的课件多数对改进课堂教学没有多大用处。而通过互联网提供的专业途径，让广大教师参与“共建、共享和资源整合”应该是一条现实并可行的途径。
其次，夯实“校校通”的基础应用层面还应该以学生为主体，以网络为载体，让广大学生在信息化教育中掌握自主学习和创造性学习的诀窍。以教学和培训为切入点，通过系统多媒体网络教程和简单易用的功能让每个学生从完全不了解Internet，循序渐进地变为建立自己的网站、管理BBS和了解Internet的网络高手。 深圳市福田区的59所中小学采用广州某公司的“校校通”学校信息化解决方案后，不仅在学校教学中应用，还迅速推广到学生的应用中。新学年开学的头两周内，已经有超过5000名学生成为福田金中环学生智能网的会员，一个个主题鲜明、形式生动的个人网站陆续建立起来，不仅让人看到这些新生代对网络技术的理解和掌握，同时，他们对人生、对社会、对文化的观点、探索和思考也尽情展示了出来。